Das honduranische Schulsystem umfasst bis zum Sekundarschulabschluss, der die Hochschulzugangsqualifikation vermittelt, elf Jahre im allgemeinbildenden Zweig und zwölf Jahre im berufsbildenden Zweig.

Es gliedert sich in folgende Abschnitte:

• Educación Prebásica, unterteilt in zwei Abschnitte (0- bis 3 Jahre und 3 bis 6 Jahre). Der Besuch der Educación Prebásica ist freiwillig, nur das letzte Jahr ist verpflichtend.
• eine neunjährige Educación Básica (unterteilt in drei Abschnitte à 3 Jahren) und
• eine zwei- bzw. dreijährige Educación Media.

Der allgemeinbildende Zweig schließt nach dem 11. Schuljahr seit 2015 mit dem "Bachillerato en Ciencias y Humanidades", bis ca. 2014 mit dem "Bachillerato en Ciencias y Letras" ab.

Der berufsbildende Zweig schließt nach dem 12. Schuljahr mit dem "Bachillerato Técnico Profesional" in der jeweiligen Fachrichtung ab.

Honduras verfügt über staatliche und private Universitäten. Die älteste und größte Universität des Landes ist die staatliche Universidad Nacional Autónoma de Honduras (gegründet 1847), an der mehr als die Hälfte der Studierenden des Landes studieren. Seit den siebziger Jahren kamen private Hochschulen hinzu.

Das honduranische Hochschulsystem sieht die folgenden Studienstufen vor:

Die erste Studienstufe schließt nach vier oder fünf Jahren mit einer "Licenciatura" oder einem Berufstitel ("Título Profesional") ab. Das Medizinstudium dauert sieben bis acht Jahre. Der Abschluss des "Licenciado" bzw. der "Licenciada" oder ein "Título Profesional" berechtigen zur Aufnahme postgradualer Studien jeder Art.

Die zweite Studienstufe schließt in der Regel nach zwei weiteren Jahren mit der "Maestría" ab.

Die dritte Studienstufe, das "Doctorado", erfordert in der Regel mindestens drei weitere Jahre. Es wird bisher nur an wenigen Universitäten und in wenigen Fächern angeboten.